​​Neslihan, Selen’e panzehri yetiştirirken Kraliçe’nin adamları kliniğe saldırmıştır. Neslihan, Selen’in kurtuluşu için kendini riske atar. Altay ise onu korumak için her şeyi göze alır. Akif Başkan’ın emriyle Korkut, Sofia’yı öldüren Kraliçe’nin peşine düşer. Kapana kısılan Kraliçe, deşifre olmamak için elinden geleni yapar fakat Korkut onunla yüzleşmeye çok yakındır. Kraliçe’nin yeni planlarını öğrenen Teşkilat Altay sayesinde bu planları bozmayı hedefler. Neslihan ve Altay verdikleri karar doğrultusunda ne Kraliçe’ye ne de yandaşlarına boyun eğmeyecektir.

Altay, Selen ile yüzleşmişken büyük bir tehlikeyle karşı karşıyadır. Neslihan ise Selen’in durdurmak için onu vurmak zorunda kalmıştır. Korkut’un Kraliçe’ye ulaşma yolundaki bir sonraki hedefi Ejder’i gözden düşürmektir. Kuracağı büyük oyunda Hamdi onun yanında olacaktır. Kate deşifre olma korkusuyla Selen’in peşindedir. Altay ve Neslihan ise Selen’in Kraliçe’nin gerçek kimliğini öğrenmek için bir fırsat olduğunun farkındadırlar. Ama önlerindeki engel Selen’in vurulmuş olmasından çok daha büyüktür. Çözüm yolunu bulmak için çıktıkları yol onları şaşırtıcı bir isme götürecektir.

Altay yüzleştiği gerçekle adeta yıkılır. Canından çok sevdiği kardeşi Selen’in hain olduğunu kabullenemez. Ona ulaşamayan Neslihan da bir terslik olduğunun farkındadır. Akif Başkan’a yapılan saldırı sonucunda Korkut ortaya çıkarak onu korumaya mecbur kalır. Ama Korkut olanları uzaktan izleyen Hamdi’den habersizdir. Akif Başkan bu saldırının amacıyla ilgili şüphelerini Korkut ile paylaşır. Korkut’u büyük bir yüzleşme beklemektedir. Neslihanlar Selen’in takibini sürdürürken Altay, Selen’e karşı açık vermemekte zorluk çeker. Altay, büyük bir hayal kırıklığıyla saldırganlaşırken Neslihan onu sakinleştirmeyi çalışır. Altay’ı yıkan bu büyük gerçek onu geri dönülmez kararlar almaya zorlayacaktır.

Altay her şeyin arkasında Ejder olduğunu öğrendikten sonra artık onun peşindedir. Korkut, kendini deşifre etmeden Altay’ı durdurmak zorundadır. Kraliçe’ye daha yakın olmak için Korkut bazı fedakârlıkları göze almalıdır. Durumlar gittikçe zorlaşırken Ejder’in hamlesi Korkut’u büyük riskler almaya itecektir. Neslihan, Makinist’in elindeki saç tellerinin Selen’e ait olduğunu öğrenir. Bu yıkıcı gerçeği Altay’a söylemeden önce şüphelerinden emin olmak zorundadır. Altay ve Neslihan, Kraliçe ile ilgili yeni ipuçları edinirler. Operasyon için Monaco’ya giden ikiliyi yeni bir tehlike beklemektedir. Altay bir kez daha Neslihan’ı kaybetme korkusuyla karşı karşıya kalacaktır.

Ejder’in gitmesine izin vermeyen Altay, Korkut ile karşı karşıyadır. Korkut ise Akif Başkan’ın emriyle büyük bir karar vermek zorunda kalır. Görev için Ejder’i oradan çıkarması gereken Korkut, Altay’ı vurur. Korkut her ne kadar Ejder’i kurtarmış olsa da yine şüphelerin hedefindedir. Operasyon uğruna en büyük düşmanıyla iş birliği yapması gereken Korkut’un ne olursa olsun deşifre olmaması gerekmektedir. Altay hedefinden kaçan Ejder’in peşine düşer. Makinist’ten öğrendiği bilgilerle düşmanının ismi onun için netleşir. Kapsüllere ulaşmak isteyen Altay ve Neslihan, Makinist’i konuşturmaya çalışırlar. Bu yolda önemli delillere ulaşan Neslihan ise yıkıcı gerçekle yüz yüze kalacaktır.

Altay, Kraliçe’nin çabalarına rağmen Makinist’i yakalar. Şimdi en büyük hedefi onunla birlikte ülkeye dönmektir. Neslihan, Altay’ın başarıyla bu görevin üstesinden gelmesi için elinden geleni yapar. Korkut ve Ejder kozlarını paylaşırken beklenmedik ziyaretle karşı karşıya kalırlar. Bu ziyaret onlar için her şeyi değiştirse de Korkut kardeşinin katilinden intikam almaktan vazgeçmeyecektir. Altay için Makinist’i ülkeye getirmek kolay olmayacaktır. Düşmanlar onları kuşatmışken yaralı Makinist’in durumu da iyi değildir. Altay onun vasıtasıyla mühim bilgilere ulaşacakları için büyük riskler alırken bu yolda yalnız kalmayacaktır.

Altay kapsüllerin peşindeyken Kraliçe’nin tuzağına düşer. Neslihan ise Muhafız’ı korumak için zorlu bir karar vermelidir. Bu kararın sebebini bilmeyen Altay ise onca insanı kaderine terk etmez. Ejder, Korkut’a gözdağı vermek ister. Bombayı fark eden Korkut hem kendini hem de etrafındaki insanları korumak zorundadır. Ancak bombayı etkisiz hale getirmeye çalışırken yapacağı hamleler Hamdi’nin dikkatini çekmemelidir. Selen, Makinist ve dolayısıyla Kraliçe’nin manipülasyonları altında korkunç bir adımın ötesindedir. Yapacağı hamle hem abisinin hem de oradaki masum insanların canına mal olabilir. Düşmana boyun eğmeyecek Altay ise herkesi bu tuzaktan kurtarmak için elinden geleni yapacaktır.

Altay bulduğu ipucunun peşinden giderken Neslihan onu yalnız bırakmak istemez. Fakat kurulan tuzakla etkisiz hale getirilen Altay, Neslihan’ın öldürüldüğüne şahit olur. Korkut, kardeşinin ölüm emrini veren kişinin Ejder olduğunu öğrenir. Ejder, Hamdi ve masadakilere had bildirmeye geldiğinde karşısında Korkut’u bulur. Bu onlar arasındaki savaşın başlangıcıdır. Kraliçe bir yandan Ejder’i çözmeye çalışırken diğer yandan da en büyük engeli olan Altay’ı ortadan kaldırma peşindedir. Altay ise büyük acılar yaşasa da asla düşmana boyun eğmeyecektir.

Altay babasıyla büyük bir saldırıya uğrar. İstediği güce ulaşmak isteyen Tufan, Ender’i ortadan kaldırmak için Ejder ile anlaşma yapmıştır. Oyuna dahil olan Ejder ise önünde kimsenin duramayacağına emindir. Korkut bu hayatta en değer verdiği insanı kaybeder. Kardeşinin ölümüyle gözünü karartıp intikam peşine düşer. Korkut Zeynep’in ölmesine sebep olan herkesten teker teker hesap soracaktır. Altay’a ulaşamayan Neslihan endişelidir. Düşmanlar ise Altay’ı yenmenin asla kolay olmayacağını bir kez daha anlayacaklardır.

Korkut, masada Kraliçe’nin kararını açıklayacakken Zeynep’in kaçırıldığı haberini almıştır. Korkut’un tek hedefi operasyona zarar vermeden kardeşini kurtarmaktır. Ejder'in dönüşü ise dengeleri alt üst edecektir. Onun varlığı, karanlığın gölgesini her yere taşıyacak, korkunun ve kaosun gerçek yüzü olacaktır. Altay ve Neslihan kurdukları plan sayesinde Kraliçe’nin kimliğini öğrenmeye çok yakınlardır. Selen ise bunu önleme ve Kraliçe’yi uyarma peşindedir. Düşmanı elinden kaçırmak istemeyen Altay kendini riske atarken Neslihan onun başarılı olacağına emindir. Altay kimseye zarar gelmesine izin vermeyecektir.

Selen, Kraliçe’nin talimatıyla Altay’ın bilgisayara ulaşmasını engellemiştir. Altay ona saldıranın kim olduğunu bilmeden verilere ulaşmak için onu yakalamanın peşindedir.Neslihan’ın Altay’a güveni sonsuzdur. Görevinde başarıya ulaşıp onlara çalınan verileri getireceğinden emindir. Akif Başkan, Korkut’a operasyonun bitiş emrini verse de Korkut ona beklenmedik gelişmeyi bildirir. Levent sayesinde ona ulaşan Kraliçe, Korkut ve Hamdi’nin masanın başına geçmesini ister. Bu durum hem masanın dengelerini hem de operasyonun akıbetini değiştirecektir. Kraliçe’nin hedefini öğrenmek isteyen Neslihan ve Altay, verilere ulaşmak ve yeni bir plan yapmak için ellerinden geleni yapar. Amaçları her zaman olduğu gibi düşmandan birkaç adım önde olmaktır.

Yapılan tatbikat sonucunda projenin başarısı kanıtlanır. Bir sonraki aşamada pürüzlerin ortadan kaldırılması hedeflenir. Altay düşmanın sıradaki hamlesini öğrenmek için görevlendirilir. Akif Başkan’ın emri ile Korkut’un görevine son verilir. Akif Başkan, onun duyguları ve amacı arasında ikilemde kaldığını düşünse de Korkut kendinden emindir. Korkut’a gelen bir mesaj ise işlerin seyrini tamamen değiştirecektir. İhsan Hoca’ya yapılan işkenceler sonucunda Kate projenin içeriğini öğrenmiştir. Düşmanlar yeni saldırılar için plan kurarlar. Altay ve Neslihan’ın amacıysa bu planları engellemektir. Altay ve Neslihan görevlerinde emin adımlarla ilerlerken Kraliçe onlara tehlikeli tuzaklar kurmaktadır. Ama Altay ne olursa olsun onları bozguna uğratacaktır.